立法院正式三讀通過「農業部組織法」，農委會升格為農業部，而首任部長竟然可能是，全民好感度最底的現任農委會主委陳吉仲。民眾超級不爽的譙翻表示，做的爛還升官，會給人不佳示範，怎麼教育小孩。國民黨立法院黨團總召曾銘宗表示，農業部雖升格，但陳吉仲仍在其位，若依舊「要蛋沒蛋、要肉沒肉」，組改也是換湯不換藥沒有意義。
歷經35年的討論，立法院終於三讀通過農業部、交通部及經濟部組織法修正案，除了農委會升格外，交通部設觀光署、中央氣象署；經濟部產業發展署、國際貿易署、能源署，以及中小及新創企業發展署，由局改至為署。
其中農委會升格為農業部，將從現行編制內的4770人，增加為5300人，主要增加在新增加的單位，包括林業及自然保育署、農村發展及水土保持署、農業發展及水保署，資源永續利用司，動保司等。
「農業部組織法」明定為辦理全國農業、林業、漁業及畜牧業行政業務，特設農業部，掌理十大業務，另設置八個次級機關，包括農糧署、漁業署、動植物防疫檢疫署、林業及自然保育署、農村發展及水土保持署、農田水利署、農業金融署與農業科技園區管理中心，組織包括部長一人、政務次長兩人與常務次長一人。
有專家表示，農水署只是接收原先水利會的財產，其實沒什麼東西可管，不用升格為署，一個司就可以了；反倒是畜牧處，開放萊豬、缺蛋等重大議題，過去幾年都發生，但這次組改，卻沒有顯示重要性，顯示改革並沒有隨著時間的變動去修正，明顯是為了改而改，除了多花錢外，沒有其他的作用力。
前台南縣長蘇煥智也批評，照理過去中央與地方組織改造，政府應該瘦身，現在反而更多單位，這樣的組改，仍是「大腦肥大症」，與過往提的組改方向背道而馳，權力沒有下放，肅貪更難，中央集權更盛。
另外，《QuickseeK快析輿情資料庫》曝光一份最新的網路好感度報告，行政院長陳建仁上任滿100天的官員滿意度，不過似乎評價褒貶不一。尤其，剛升格為農業部的農委會，最有可能成為首任部長的主委陳吉仲，近一百日好感度僅0.17，是陳建仁19位部會首長的最底。
根據臉書粉專《QuickseeK快析輿情資料庫》在臉書上表示，最新的網路好感度結果顯示，在陳建仁上任行政院長一百天至今，陳吉仲近一百日好感度僅0.17！
主要是因「缺蛋」導致蛋價飆漲之民生議題遭在野各黨以及民眾強力批評；倒數第二名為經濟部長王美花，近一百日好感度0.19，同樣因民生議題如各項小吃、便當、民生用品物價飆漲，再加上水、電價皆上漲，還有經濟部近期「試辦冷氣適溫運動2623」，也就是所謂「限溫令」政策都造成民眾強烈不滿，使王美花好感度持續維持在低點。
再來，陸委會主委邱太三倒數第三，好感度0.2，因四月中邱太三表示希望ECFA繼續談，若中止ECFA將造成台灣中國雙方損失，破壞兩岸關係，遭大量網友反酸「說好的糖衣毒藥呢？」。
另外，好感度超過１的首長只有二名，包括文化部長史哲及海委會主委管碧玲。史哲推出「文化成年禮金」，以及文化部修法重懲黃牛，再加上文化部積極推廣口碑極佳的優質台劇《人選之人—造浪者》，都讓史哲部長獲得不少正面評價；而管碧玲則因四月初台籍客船與中國大陸海巡艦爭議事件中，痛斥中國大陸大外宣，對中態度強硬，導致好感度上升。