黃健庭擔任立法委員期間，張姓助理被控和藥商向當時的衛生署與中央健康保險局施壓，同意健保給付特定用藥，且核定較高藥價，再向退輔會及所屬醫院施壓或利誘，採購及濫開特定用藥，藉以牟利。
台中地檢署偵辦時，發現黃健庭所屬的健康家庭文教基金會涉嫌收受藥商上百萬元回扣，民國97年依貪污罪起訴黃健庭。
監察委員今天到台東接受人民陳情，台東縣民進黨籍議員林參天向監委檢舉，台北地方法院審理黃案有弊端，案件在法院躺了6年，不停換法官，至今尚未進入審理庭。
黃健庭表示，案件已進入司法程序，靜待司法調查，他對自己清白絕對有信心，案件進入法院這麼久，他也很無奈，也是受害者，期待司法儘快有結果，還他一個公道。