政府簽署服貿協議前，郝明義曾發表公開信，呼籲馬總統暫緩簽署，但意見未獲馬採納。昨郝出席公聽會時，當場發放「總統不能罔顧國家安全，破壞民主程序，錯亂政府體制」的公開信，並宣布已發函給總統府，辭去國策顧問職務。
郝明義說，他請辭很重要的原因，就是政府體制已錯亂，服貿協議引發民眾反彈，但從頭到尾都不知道誰決議，出了事總統跟經濟部長到全國奔波滅火，嚴重浪費國家資源，應該讓負責談判的人出面、負責。
另外，郝明義在公開信中，希望馬總統以後聽到民間的批評，不要再說固定的那一句「謝謝指教」，全民付馬500萬的年薪、1年2兆的預算，不是想聽到這句話。他更呼籲國民黨立委，不要當投票部隊，如果輕易表決服貿協議，就是有愧於人民的託付。