疾病感染原無所不在，台灣一名熱愛園藝人士，在整理菜園時手捏蝸牛，不料這個動作讓她持續頭痛、甚至出現意識不清、惡化成腦膜炎，利用常規檢查、最新分子檢驗都無法檢出病原體，直到透過次世代基因定序 mNGS 才在 24 小時內，即時檢出是「廣東住血線蟲」感染，國外文獻統計指出感染這類寄生蟲若未及時治療，致死率可達5%，但留下腦神經後遺症的比例卻高達 70 %。
台大醫院教學部盛望徽教授暨主任指出：「由於現今寄生蟲感染個案少，醫院沒有常設寄生蟲檢測，好在有次世代基因定序能在短時間就能做近萬種致病原檢測，讓患者在黃金治療時間內找到關鍵致病原進行治療。」新的分子檢驗技術是精準醫療的時代下重要的新利器。
感染症表現相似！一次看懂常規感染檢測
感染症與一般常規疾病有很大差異，許多患者症狀表現都是「急性」，加上一開始關鍵導致感染的主因並不清楚，尤其讓感染科醫師最頭疼的是，「有很多致病原表現都是相同臨床症狀，我們就很難去臆測是哪些真正的致病原。」盛望徽說到。
常規病原體檢測主要有四大方向：
＊細菌染色：取得檢體後進行染色，但能成功檢出率較低。
＊微生物培養：利用血液、感染組織進行培養，但至少要 2-10 天才能初步結果，有些菌株需要時間更長。
＊聚合酶鏈鎖反應 (PCR)：對特定 DNA 序列大量合成，進行專一性的連鎖複製，但一次只能檢驗出一個致病原，當無法猜測可能致病原時，往往都會是陰性的結果。
＊Multiplex PCR :比起一般 PCR 可以同時檢測、鑑定多種病原體，但同樣面臨醫師需要先假設可能病原體。
分子檢驗技術仍面臨困境！
如果患者免疫力低下狀況時，在極少致病原就足以產生感染，這時候用傳統檢測下檢出率都會偏低。此外，盛望徽從臨床經驗發現，即便連先進的分子檢驗技術下仍有其侷限性，包括如果是新興傳染疾病一開始不知道是什麼致病原是無法篩檢，仍仰賴醫師初步進行臆測。
如今次世代基因定序有機會突破其困境，盛望徽提到：「它的好處臨床醫師不需要去臆斷假設，提供核酸資訊後，可以得到許多數據資訊，讓臨床醫師做更全面性的診斷。」
否則傳統等待培養、或是一般 PCR 檢驗出來資訊也相對有限，若是等病程完整表現後，才能知道致病原，多半個案來不及在黃金時間內得到最好的治療，盛望徽不諱言這種狀況下，醫師在面對棘手、不常見感染病原時，很難即時有效的給與病患最佳的臨床處置。
醫師：腦膜炎延後一天治療預後差別大
而這次這名熱愛園藝的患者就是驗證次世代定序對於急、難、雜的感染症的重要性，由於該名患者送到醫院時意識不清，醫師懷疑可能是中樞神經系統感染，進行常規及生化檢測，確實觀察到白血球驟增，各項指標都指向感染的可能性，且患者狀況每況愈下還併發腦膜炎。
但利用醫院有的最新分子病原檢驗皆無法測出致病原，讓醫師陷入治療上難題，當時揣測若是非典型細菌感染得用抗生素；若是自體免疫疾病應該要類固醇；若為結核菌得用結核菌藥物，但一直無法確定致病原難以對症下藥。
當下決定徵求家屬同意，抽取腦脊髓液緊急送檢感染病原次世代 mNGS 檢測，隨即在 24 小時內檢出「廣東住血線蟲」，盛望徽說：「收到結果確實滿訝異，當時擺在比較後段的鑑別診斷，但從患者的臨床病症也確定符合『寄生蟲』感染。」
醫院無常規寄生蟲檢驗及藥物！及早檢出挽救一命
由於寄生蟲感染現今在國內罕見，一般醫院內並無常規寄生蟲檢驗及抗寄生蟲藥物，皆需疾管署協助調派。緊急通知家屬後，家屬委託國外友人買藥寄回台灣及時給病患使用，且同步將檢體送到疾管署檢驗，經過 13 天後，也確認是寄生蟲感染。
後續回想起整個診斷過程， 盛望徽有感而發：「感染此蟲後死亡率為5%，雖然不高，但是留下腦神經後遺症的比例高達70-80%，包括嚴重者導致失明、癱瘓或是死亡。」
好在患者經過治療下已經順利康復，後續追尋確認感染來源才發現，患者平時熱愛園藝活動，但怕蝸牛吃掉作物，才會在無保護下手捏清除，後續因沒清潔雙手又拿東西吃，而造成的感染。
三大族群適用次世代定序輔助
次世代基因定序 mNGS 有如戰場上的大刀，幫助醫師在臨床上更快速地進行診斷，考量在符合經濟效應之下，盛望徽認為有三大族群適用於這樣的檢測技術：
- 感染重症者：在嚴重感染的患者，舉例像敗血性休克、腦膜炎，及早診斷延緩病情惡化。
- 診斷不明的個案：臨床上出現症狀、檢驗結果不一致，常見像是患者在藥物治療之下，病情仍沒有改善，或患者的病情表現跟醫師臆想是有很大的不同。
- 免疫力不好的患者：免疫功能低下者在少量的致病原就有可能感染，少量的致病原在常規培養檢出率是低，藉由分子檢測可以檢驗出來。
盛望徽表示：「新的分子檢驗 mNGS 技術有助於檢驗時間縮短，同時也能夠改善患者預後，及早使用到合適的藥物。唯獨在經濟效益上的考量，必須由醫師和患者共同找到合適治療策略。」
目前盛望徽手上至少有 10 例患者，藉由次世代基因定序的方式，及時診斷治療下將患者從鬼門關拉回來，他回憶有幾例個案印象深刻，一名 80 歲老先生出現腦膿瘍，做了許多檢查也找不出致病原，透過基因定序才發現是因為老先生牙周病導致厭氧菌的感染。
另一名患者則是發炎性的骨關節感染，使用類固醇、抗發炎藥物也遲遲沒有改善，直到後來藉由次世代基因定序，才發現是極少量的金黃色葡萄球菌所造成，順利找到致病原才讓患者病況大幅改善。
新的分子檢驗技術可彌補過往常規檢測上的困境，現政府已制定實驗室自行開發檢測特管辦法 (LDTs) 將此類技術全面納管，經由合格的單位提供檢測服務，方可保障民眾權益。透過國家認證的病原基因檢測服務 (mNGS)，其全面、精準、快速的特性，有機會挽救更多感染患者，盛望徽期盼：「精準醫療就是希望能夠找到確定的致病原來做治療，也是未來臨床運用上的新趨勢。」
文、王芊淩／圖、巫俊郡
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