台灣港務股份有限公司花蓮港務分公司表示，近年來利用港區地理環境特性，致力推動各項環保、節能創新作法。其中「花蓮港水資源銀行」創新提案，建置水撲滿有效回收地表水，作為港區抑塵洗車及綠化使用，獲得行政院創新應用獎第一名。
此外，全國第一個在海岸線的地下箱涵道路「北濱外環道路」，讓進出港區作業車輛通行地下化，有效減少污染及噪音；以鐵路、海運複合式運輸方案，採鐵路取代公路運輸，降低蘇花公路的負荷及環境衝擊。
花蓮港務分公司提供4.6公頃港埠土地，配合花蓮縣政府於北濱海岸興建景觀休憩區，作為港口與周邊的綠色緩衝帶，並連接七星潭及鯉魚潭自行車步道，成為民眾最佳休閒處所及觀光亮點。
花蓮港務分公司指出，民國104年即向歐洲海港組織申請生態港國際認證，經2年努力準備及兩階段評核，今天歐洲海港組織委派查核單位─英國勞氏檢驗公司至花蓮港現地查核，通過「歐洲海港組織生態港(EcoPorts)國際認證」。