馬習會之所以「貶大於褒」，首先是「程序黑箱」。
綜觀馬習會，在形式上已做到「最低底線」的對等，包括兩岸領導人互稱「先生」，回避雙方的國號、國旗，明顯這是雙方各退一步的折衝結果，雖不滿意但可以接受。而儘管馬總統在馬習會僅能稱為「先生」，但國際媒體報導的頭銜多為「Taiwanese President Ma Ying-jeou」，對於提升台灣的國際知名度有一定的效益。
另從陸委會今天公佈的閉門會議馬英九總統談話全文來看，馬總統確實在一定程度上「該講的都講了」。
例如馬總統當著習近平的面，談到「一中各表的九二共識」、「中華民國憲法」；經貿議題方面，馬總統向習近平表達，台灣「現在正在申請加入TPP，希望將來能加入RCEP」，對於台灣工商界在乎的貨貿協定、互設辦事機構、與陸客中轉等，馬總統向習近平表達「應儘速辦理」。
但相較馬習會後國台辦主任張志軍記者會的「強硬」，馬總統的態度不夠「堅定」，是讓台灣人民觀感不佳的原因之一。
最關鍵是的，馬習會的程序完全是一個黑箱的結果，這與秘密外交絕對不一樣。
因為兩岸關係的敵對狀態、中共始終企圖吞併台灣的不懷好意，使用什麼樣的國號、要去談什麼，這些都是何等嚴肅的問題，特別是台灣人民的國族認同很複雜，兩岸領導人的會談，實在不宜跳過在野黨、跳過國會同意等程序，如此私相授受。
尤其是，馬總統是一位即將卸任的總統，已被視為看守狀態，也不宜去談如此重要的兩岸議題。[NT:PAGE=$]
「貶大於褒」的原因之2，是習近平沒有提出令台灣人民有好感的承諾。
國際輿論普遍認為，馬習會是一場政治秀握手會，從馬習會的結果來看也是如此，馬總統委婉提出台灣人民的幾項期望，但習近平卻沒有給予善意承諾。
例如，撤除瞄準台灣海峽的飛彈，讓台灣的NGO非政府組織參與國際上純粹功能性組織，習近平絲毫沒有一點讓步的意思。
馬總統一向自豪自己處理兩岸事務的能力與政績，可以在歷史上留名，但馬總統對習近平的諸多讓步甚至是「配合演出」，卻沒有換來什麼具體的實質意義，這也是讓台灣人民失望的原因之一。
馬習會之後，要持續關注的發展焦點至少有二。
已有一場馬習會的意外在先，馬總統在明年5月卸任之前，在兩岸關係上是否又會有什麼驚人之舉，例如一直有傳言兩岸準備簽下「和平協議」，再度掀起軒然大波，這已讓各界心生顧忌。
另外，下一屆新任總統普遍看好由蔡英文勝出。對於兩岸關係，蔡英文在目前的競選期間一直主張「維持現狀」，由於她拒絕講清楚「現狀」的定義到底是什麼而飽受批評。
若是善意去理解蔡英文的刻意迴避，她的意思可能是，台灣人民的國族認同本來就是複雜、多元的，她想做一個中間路線的全民總統，台灣與對岸要以什麼關係來定義，應該透過國是會議等方式充分溝通之後，甚至是公投，全民取得共識再與對岸談。
蔡英文已表示上任後不排除舉行「蔡習會」，但是到時候，蔡英文會不會服從這個民意忠實執行，會否重演「馬習會」的黑箱程序，會否上演另一場大暴走，也將受到嚴厲的檢核。