文化部長洪孟啟近來因立委爭取補助案惹議，再加上內部會議紀錄外流，導致風暴越演越烈，而當時遭影射疑似為洩密者的文化部次長邱于芸為了自清，不僅發出聲明表示未洩密外，還寄發存證信函給文化部長洪孟啟，引發爭議。
對此，行政院長毛治國16日在立法院會答覆國民黨立委孫大千質詢時表示，同仁間溝通的方式有很多種，但寄發存證信函的形式並不恰當。毛治國說：『(原音)部裡面的次長，她以法律文件表達意見，事實上不是一般的作法，這種作法也並不適當。同仁間溝通的方法有很多，所以我希望像這樣的事件，能盡快落幕，讓文化部業務回到正軌。』
孫大千關切文化部補助案的調查何時出爐？毛治國表示，目前已進入司法調查階段，他不評論個案，一切尊重司法。
法務部長羅瑩雪則指出，廉政署已進行相關人士的約談，第一階段的調查結果已出爐，會將相關資料儘速提報行政院。羅瑩雪說：『(原音)我們希望它盡快，所以第一階段的調查今天已送到部裡，所以我們馬上會報到院裡。』
另外，媒體報導指出，因為文化部洩密風暴，洪孟啟或邱于芸勢必要有人辭職，行政院發言人孫立群受訪時表示，目前為止都沒有收到2人請辭的消息，政院人士也私下透露，並沒有收到要異動的通知。