對於先前引發爭議的第三方支付問題，總統說，剛開始大家認為不宜有任何改變，免得造成風險；但從全世界發展經驗來看，別人都經歷一些問題且有克服的方法，風險當然是有，但要想辦法減少，而不是因為有風險就原地踏步。
他表示，第三方支付規劃初步問題解決了，仍有需要克服的部分，但至少在行政院努力下已經走出這一步，今年底前將完成制定第三方支付專法，以加速電子商務的發展。尤其台灣是小而開放的經濟體，除應迎頭趕上歐美國家，更要力求超越。
面對全球競爭，馬總統表示，政府將盡快就電子商務及新興產業發展進行必要的政策開放及法規鬆綁，並針對金流、物流、通關、稅務及消費者保護等相關議題研擬管理機制。政府有能力，也有雄心，未來將持續結合年輕人的力量，為電子商務產業掃除障礙，開創無限商機。
對於與會者關切酒類、醫藥用品等管制商品可否開放網路販售，總統表示，政府不會因噎廢食，會從實務上去了解已開放國家的落實情況，但同時也要考量國情，研擬出相關的控管機制，以保障國人健康與生命安全。
馬總統上午與電子商務產業團體座談，與會者包括台灣網路暨電子商務發展協會理事長詹宏志等人，會中針對「電子商務產業國家未來發展策略」、「第三方支付服務規畫」及「兩岸服務貿易協議中電子商務後續協助事項」等議題廣泛交換意見。
總統致詞時指出，電子商務是消費方式的革命，除對台灣服務業及製造業未來發展影響深遠，更有助於資通訊科技產業（ICT）突破現有困境，因此，政府應強化跨部會整合，提升相關策略之高度。
首先，由行政院研議在院內成立專案小組，全力推動該產業發展；其次，相關部會於擬訂「電子商務發展綱領」等策略時，應多聽取年輕創業者意見，務求相關策略的宏觀與可行性。