洪慈庸並質疑，憲兵官蔡忠銘因為不肯處理洪仲丘送禁閉案才迅速被調職，後面是不是有高官指示，什麼人有這樣的權力去指揮這樣的事情，都必須要釐清。
她並說，五四二旅士官長陳以人的部分也是，因為串供大會是陳以人講出來的，陳以人可能知道許多事情，家屬也希望檢方能針對陳以人部分加以了解。
至於二六九旅禁閉室的戒護士陳毅勳，洪慈庸表示，陳毅勳的角色比較特殊，他被控凌虐部屬致死罪，最重可處無期徒刑，是被起訴的十八人中罪名最重的人，現在形同被軟禁在蘭指部，家屬認為他可能有些事情本來很想講出來，卻沒辦法講，現在移到一般司法審理，希望一般司法可給予他更多的保護，讓他能夠講出事實。