行政院環境保護署綜合計畫處說明修正草案內容，單看審查環境影響說明書一項，現行三級收費金額分別是每件新台幣15萬元、9萬元和6萬元。修正案施行發布後，將調整為特大型開發行為每件54萬元、大型開發行為37萬元、中型開發行為14萬元和小型開發行為10萬5000元。
環保署綜計處表示，修正原因為立法院社會福利及衛生環境委員會在審查102年度環保署及所屬機關預算時提案，將審查費提高10倍，並決議應參酌規費法規定，儘速檢討現行收費辦法合理性。
綜計處指出，立法院第8屆第2會期時又凍結環保署「環境影響評估」1/5預算，並要求環保署應公告新版的符合立法院歲入增加的環評書件審查收費表，於修正後解除凍結相關預算。
環保署經過多次精算，並報請財政部同意，檢討原訂定的收費辦法，原訂的收費金額不足以支應目前審查費用的實際支出，因此提高現有的收費標準。
環保署說，對於特大型的重大開發個案，開發行為規模及審查實務所涉可能影響的生活環境、自然環境、社會環境及經濟、文化、生態等程度與範圍龐大，經檢討在收費辦法中增列特大型開發規模，並依開發規模訂定4種不同規模審查費收費級距。
環保署表示，這次修正條文已詳載於環保署網站，其中環評審查費收費額度調整將從103年1月1日施行。