糾正案文指出，台灣每年有3000個女嬰消失，台灣每年約有7萬名胎兒可能遭人工流產，國民健康局長久以來未建立人工流產的通報及監控機制，也未實地訪查，更未積極研議有效的稽查原則、重點及流程，遲至99年下半年起才開始推動禁止違法性別篩選與選擇墮胎措施，也只查獲1家婦產科診所違規進行性別篩檢。
在南非出差的衛生署國民健康局局長邱淑媞獲悉此事，她說，台灣長久以來重男輕女，過去法令不完備，相關同仁近2年來不斷加班、開會與溝通，最近嬰兒性別比例失衡的問題有點改善，此時卻反遭監察院糾正，心情相當沉重。
衛生署今年中調查指出，去年男女嬰比為1.09比1，推估有3000多個女嬰消失，並發現彰化縣、台中市、桃園縣與台北市最「重男輕女」，國健局已行文要求相關醫師及診所說明，醫事處則擬對違法篩選性別的醫師依「醫師法」開罰。
對於監察院沒有鼓勵，反倒提出糾正，是否會使公務員覺得不做不錯、多做多錯？邱淑媞表示，「沒辦法，政府制度設計就是如此，只能加以尊重。」
台灣婦產科醫學會秘書長黃閔照表示，不管是用血液檢查、傳統手術、或是服用墮胎藥都無法解決男女失衡問題，重男輕女的觀念仍是普遍存在，尤其是鄉村地區比都會區嚴重，需要社會風氣的改善才是直接解決的辦法。
黃閔照說，過去婦產科會以母親血液檢查嬰兒性別，但這需大於8週以上，現在已經禁止。終止妊娠的另一方式是在懷孕7週內服用RU486，統計資料顯示，選擇口服者與傳統手術墮胎比占2比1。