免疫系統的過度反應是許多問題的主要原因：正常的身體組織，往往會在免疫細胞追捕病原體的過程中遭到重創，身體因此遭殃。一個系統越複雜，它出錯的方式就越多，免疫系統也不例外。免疫系統要完成的任務非常多樣、非常精細，它出錯的方式也是五花八門。下面是簡要概述：
1.免疫病理學
對身體來說，即使是一個順利執行的免疫反應也有其代價。在免疫系統對感染反應的關鍵時刻，免疫細胞在追捕逃逸的細菌（它們以極快的速度分裂、複製），或者努力迅速找出那些已經感染了病毒的細胞，各種有害的酶體和病原體的片段體液裡流動，一些意外傷害似乎在所難免。
事實上，許多情況下病原體本身並沒有那麼有害，免疫系統的過度反應才是許多問題的主要原因：正常的身體組織，那些「無辜的圍觀群眾」，往往會在免疫細胞追捕病原體的過程中遭到重創。對於慢性疾病，這種情況尤為嚴重，因為病原體非常善於躲藏，神出鬼沒。結果，免疫系統一再地發起攻擊，身體因此遭殃。
2.免疫缺乏疾病
當免疫系統的某個環節缺失了，或者不工作了，人體就會出現免疫缺乏疾病。有時候，這是一種遺傳疾病，源於某種基因突變；另外一些時候，這是環境因素的作用。最著名的一個例子就是愛滋病（全名：後天免疫缺乏症候群）了，這是源於HIV病毒攻擊T細胞，導致身體的免疫反應嚴重受損，從而容易引發其他感染。
3.發炎
發炎反應之所以出現，是由於蛋白訊號召集白血球和抗菌物質來到感染部位，引起附近的血液和淋巴液 19 加速流動，以協助適應性免疫反應達到最佳效果。發炎反應是正常免疫反應的一部分，隨著免疫過程結束，它也會自然消退。不過，由於種種原因，如果發炎反應遲遲沒有消退，繼續引起疼痛和傷害的時候，這就有問題了。
4.自體免疫疾病
因為免疫系統有可能對任何東西發起攻擊，它當然也有可能攻擊身體內的任何分子和細胞。人體內有一種篩選機制，避免免疫系統攻擊自身（在第二章我會詳談），但是它一旦出錯，你就會患上自體免疫疾病。如果它攻擊的是胰腺中分泌胰島素的細胞，你就會患上第一型糖尿病；如果是其他的細胞類型，你就可能患上類風溼性關節炎、紅斑性狼瘡、多發性硬化症、自體免疫性肝炎、重症肌無力、克隆氏症⋯⋯自體免疫疾病你可能也聽說過，因為它非常普遍。
5.過敏症
有時候免疫系統會過分敏感，對無害的抗原小題大做。比如，在演化史上用來對抗腸道寄生蟲感染的免疫反應，在今天可能已經沒有可以攻擊的對手了。
本文出自麥田出版《我們為什麼還沒有死掉？史上最有趣的免疫系統科學漫談》一書
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