首場日本食品輸台公聽會上午在環境幽靜的台南農業改良場舉辦，由農委會國際合作處長陳俊言主持，農委會副主委陳吉仲則到場坐鎮、行政院食品安全辦公室、衛福部、行政院原能會都派人列席。
公聽會開始不久後，台南市議會國民黨團書記長蔡育輝、黨籍市議員盧崑福及20多位抗議民眾，進入會場要求停辦公聽會，他們批評中央偷偷摸摸開公聽會，暗渡陳倉。
在抗議聲中，群眾搗毀主席桌上的文件、杯水，盧崑福更和陳俊言發生兩次推擠，且在會議結束前10多鐘前，怒掀主席桌。
面對群眾的痛罵，陳吉仲揚言「若言語涉及人身攻擊，他將保留法律追訴權」。陳俊信則說「記者都拍完了，可以啦」。
在混亂中，警方調派大批警力到場戒備，公聽會一席中斷近1個小時。當公聽會重開時，抗議群眾批評公聽會依法得事先公告10天，行政院明顯違法，今天的公聽會不能算數。
陳俊言說，民眾質疑程序問題，他們會檢討，若市議員有意邀集開會，他們也願意出席說明。待公聽會預定時間2小時一到，陳俊言宣佈會議結束。
陳吉仲和陳俊言等人隨即在警方護送下離開會場，陳吉仲接受媒體訪問時表示「公聽會已經完成」。