警方發現遺體後，當天就採集死者指紋送往刑事局比對，發現死者是名王姓失蹤人口，警方隨後聯絡王男的家人。家屬表示，王男9月20日接到許姓養殖漁民的電話，2人是幾十年的朋友，王男常常跟許男借錢，但又常跳票不還，至今已積欠三百多萬元。
警方調閱路口數百支監視器及行車記綠器進行比對，發現王男的車輛與許男車輛路徑有重疊路線，且許男從9月20日後即避不見面，懷疑他涉嫌重大，並在國道8號安定段橋下發現王男車輛，在裡面驗出血跡反應。
另外，警方還查出一名幫忙棄屍的共犯莊男，因受到颱風侵台的影響，9月29日警方先拘捕莊男，許男自知難逃法網，最後自己到市刑警大隊投案。許嫌供稱，因與王男有債務糾紛，在車上發生口角，當時是王男一邊開車一邊從駕駛座掏出手槍，抵在許男的胸口，許男趁王男開車不注意時，搶槍反制卻不慎走火擊中王男。
許男表示，王男尚未斷氣前，曾要求他棄槍協助送醫，但在途中王男就氣絕身亡，他才會找來莊男幫忙棄屍，又擔心王男的血流出來，因此幫他穿上青蛙裝，擔心遭到報復又用膠帶將王男眼睛封住，並燒紙錢給對方。不過警方對許男說詞存疑，且目前還未找到槍枝，警訊後先將2人移送台南地檢署偵辦，2日晚間11時台南地院諭令許男收押禁見。