環保署表示，擱淺於金門古崗海岸的大陸籍貨輪「港泰台州號」因船身破洞，船上的焦油球及瀝青塊等殘油外洩，環保署已指派應變廠商赴現場投入油污清理工作，並調派應變人力與機具前往支援，包括國軍及海巡署人員也都投入除油工作。環保署長李應元18日赴現場勘查後，強調中央將全力協助解決油污問題，金門縣政府經費不足的部分由中央支出，預算編列無上限，務必要在1周內完成清污，早日解除海洋污染危機。環保署水保處長葉俊宏：『(原音)沙灘上的油污大概2天到3天可以清除，礁岩間的油污大概7天到10天可以清除，最快在7天可以清除油污。目前的應變策略是岸際的部分先除污，船的漏洞部分今天會去看看，怎麼樣把破洞的部分先補起來，不要再讓它洩漏，這兩個動作做完以後，船的移除會由交通部航港局來處理。』
重達4萬4,000噸的「港泰台州號」是在15日下午被莫蘭蒂颱風從廈門吹到金門古崗海岸擱淺，環保署指出，由於其船公司已經破產，未來將由金門縣政府及交通部航港局透過陸委會循兩岸事務協調機制向陸方船舶保管人求償。
另外，環保署表示，也因莫蘭蒂颱風而擱淺於高雄西子灣的「順天606號」及「永興發168號」2艘漁船，其外洩油污已清除完成，環保署空拍顯示海面已無污染情形，將持續監控後續相關作業。