據新台灣人文教基金會指出，該基金會為前總統馬英九於1999年間，以競選其台北市長補助款1200萬元成立，目前資產約2300萬元。馬英九並未在基金會內擔任任何職務，基金會也無捐助任何政治人物，周玉蔻用陳述事實的方式對外發言、散布不實言論，已屬侵權。
周玉蔻日前出庭對此辯稱，針對新台灣人文教基金會，各界都曾討論過，她僅是針對馬總統在基金會的角色加以討論、評論，並沒有惡意，且讓基金會禁得起檢驗，也是好事，沒想到卻挨告。今天台北地院判決出爐，周玉蔻必須在《蘋果日報》等5家報紙，刊登啟事向基金會道歉。免賠1元。