行政院6日中午公布「桃園機場淹水調查報告」，指出桃園機場的防洪排水系統是根據10年防洪標準設計，且當天的降雨量1小時為87釐米、3小時累積降雨為151釐米，不足以釀成這麼嚴重的災情。
根據公共工程委員會的調查，桃機淹水的主因H幹管的三孔箱涵有大量土石淤積，以及地下勤務通道的防水閘門沒有及時關閉，與埔心溪倒灌無關。政務委員兼工程會主委吳宏謀說：『(原音)埔心溪沒有把水倒灌回來，我們也發現其中的H幹線，中間有一個三孔箱涵，上游端有大量淤積，這是造成這次排水不良、淹水溢流的主要原因，中間有一個防水閘門當時桃園機場也沒及時予以關閉，所以整個雨水就灌入航站大廈B2美食街。』
工程會副主委顏久榮表示，強降雨確實是因素之一，但主要肇因是人為疏失，若箱涵被砂石堵塞，使得泥水湧高溢出，以及閘門若有關閉，災情也不會這麼嚴重。
吳宏謀表示，希望桃園機場一週內全面檢視所有內、外排水系統，保持暢通；機場內部的施工也要保持排洪通路暢通；以及加強河川水位監測與桃機通報橫向聯繫機制。