總統當選人蔡英文15日下午公布國安團隊人事布局。她宣布由國安會前副秘書長、政治大學前副校長林碧炤出任總統府秘書長，民進黨秘書長吳釗燮擔任國安會秘書長。
蔡英文表示，她就任之後要領導社會對話，對內在重大議題上凝聚社會共識，對外面對越來越複雜的國際情勢，她需要好的幕僚長形塑國家戰略，以確保國家安全和區域穩定，也讓內部改革在穩定的政治環境中運行。蔡英文說：『(原音)總統必須統合國家產業、經濟貿易、社會、政治與外交能量，形塑經貿戰略，並主導對外經貿關係的進行，這幾個重大任務要有好的幕僚長來輔佐總統。』
蔡英文表示，林碧炤學養俱佳，在學界和政界都備受尊重，且是傑出的國家安全學者，同時也具有政治決策經驗，對總統府事務不陌生，她希望借重林碧炤的經驗協助推動政務。
蔡英文也指出，吳釗燮一直都在兩岸、外交最前線，專業與沈穩的形象外界有目共睹，在國家安全超越傳統安全領域的現在，她需要吳釗燮沈穩的特質面對全新的環境，並希望組成沈穩與專業的國安團隊。
蔡英文表示，她很高興有林碧炤與吳釗燮進入總統府擔任國安團隊左右手，未來希望借重他們豐富的學術與實務經驗，一同擔負新政府的重任。