目前傳出的茲卡病毒本土疫情，主要集中在中南美洲及加勒比海地區。由於拉美地區是中華民國的邦交國重鎮，外交部官員16日表示，已通電各駐外館處與技術團，要求所有同仁及其眷屬務必注意健康管理、做好防護工作，駐外人員也應隨時掌握當地最新資訊並即時回報。
至於中國大陸目前也傳出2起茲卡病毒感染個案，負責處理大陸、香港、澳門旅遊警示資訊的陸委會表示，是否發布相關注意訊息，尚需配合衛福部專業意見再進行後續作業。
如果有民眾要前往茲卡病毒流行地區，衛福部建議穿著淺色長袖衣褲、塗抹衛福部核可的防蚊藥劑，以及居住在有紗窗、紗門或空調的房舍。但一位曾經在外派期間多次得到瘧疾的外交官受訪時說，他們是長期在這些國家工作生活，很難避免染上當地的流行疾病，這是身為外交人員必須承擔的風險，所以他並不會特別在意這些問題，唯一不捨的是家人也曾因此全部感染過瘧疾。