日本放送協會（NHK）等媒體報導，今天上午10時左右，靖國神社南門附近的廁所傳出爆炸聲響，有火苗竄出。當時，靖國神社正舉行祈求五穀豐收的「新嘗祭」，參拜者不少，所幸沒人受傷。
爆炸案發生後，警方調閱監視器發現，在爆炸聲響傳出前，有1名拿著紙袋類物品的男子從男廁離去。警方研判，很可能是有人針對靖國神社下手，安裝了定時引爆的爆裂物。警方正調查該名男子與爆炸案的關連性。
受到法國巴黎恐攻事件影響，日本警察廳（相當於警政署）也下令全國警方加強蒐集有關恐怖行動的資訊，像是官邸、法國駐日大使館等重要設施、人潮聚集處等，都須加強警戒。
4年前，靖國神社曾遭人潑灑燈油縱火，後來查出此案與在日本駐南韓大使館投擲火焰瓶的中國大陸男子有關。日本警視廳以涉嫌縱火為由，對這名男子發出逮捕令。
前年，靖國神社又遭1名南韓男子闖入，拿著裝有稀釋劑（thinner）的寶特瓶、打火機等企圖點火引燃，該名男子後來被起訴。