一般來說，C型肝炎從得到開始，平均2到20年會進展成肝硬化，一旦得到肝硬化，每年約3%的病人會得到肝癌。B型肝炎則較為複雜，在台灣，大部分的B型肝炎患者是出生時由母親垂直傳染給胎兒，這樣的病人一部分在20-30歲左右會有一次急性肝炎發作。不論慢性肝炎的原因為何，一旦產生肝硬化，肝癌的機會就將大幅的增加。也因此，在美國、歐洲以及亞太地區，都建議一旦有慢性B型或C型肝炎，甚至肝硬化，就須定期接受篩檢，期能達到早期發現，早期治療的目的。一般的建議是每三到六個月追蹤一次超音波。在台灣，除了超音波之外，還會抽血檢驗胎兒蛋白。
從國健署的資料來說，去年(民國103年)台灣十大癌症的發生率，肝癌占第四位。死亡率占第二位。而診斷肝癌時的期別，只有約30-40%為早期可以開刀或是接受根除性治療。顯示目前仍有將近6成到7成的病人在診斷肝癌的時候屬於無法根除的中期或晚期。
成大醫院胃腸肝膽科院主治醫師簡世杰表示,肝癌的預防，除了定期篩檢外，還有對於慢性肝炎的治療。透過B型肝炎及C型肝炎的治療。原本肝硬化的病人，肝臟有機會變成沒有肝硬化。舉例來說，根據成大的研究，過去發表在新英格蘭醫學雜誌，慢性B型肝炎患者在長期使用抗病毒藥物數年後，部分可以從原本的肝硬化，進步到輕度，中度纖維化，甚至到沒有肝硬化。對於C型肝炎患者如果治療成功，也可以達到類似的效果。而經由對慢性肝炎的治療，也可以大幅降低肝癌發生的機會。
C型肝炎的治療，過去以來皆是使用皮下注射長效型干擾素及口服雷巴威靈。由於干擾素的許多副作用，因此一直無法普及。近年來許多的C型肝炎口服藥物問世，使得C型肝炎的治療開始朝向沒有干擾素，沒有雷巴威靈的全口服藥物處方，副作用少且療效更佳。從今年開始，全口服C型肝炎藥物，在成大也開始可以使用，唯截至目前為止，健保仍不給付。
慢性肝炎患者，一旦得到肝癌，簡世杰說明以下的肝癌治療方式：1:早期肝癌：手術或射頻電熱燒灼術、酒精注射。
2:中期肝癌：栓塞、肝移植、(合併手術或射頻燒灼術)。3:晚期肝癌：口服標靶藥物。4:末期肝癌：支持性療法。
近年來在成大，手術及射頻燒灼術都有顯著的進步，手術方面，成大在今年度引進了達文西機械手臂，開刀時傷口可以更小，以往腹腔鏡無法開刀的位置變得可以到達，使病人復原更快。射頻燒灼方面，成大醫院腸胃科邱彥程醫師是目前台灣唯二使用多針燒灼的醫師。可以將腫瘤燒灼的更乾淨，更完全。栓塞治療，目前成大已有引進多種栓塞粒子，栓塞的效果更好、副作用也更少。
從2008年起，晚期肝癌(有血管侵犯或肝外轉移)的病人健保也給付標靶藥物sorafeib(雷莎瓦)。從歐美及亞太的研究皆指出，晚期肝癌病人使用雷莎瓦，可以有效延長病人存活率達2-3個月。這樣的效果差強人意，所以近年來各方醫院都在討論如何延長晚期肝癌病人的存活率。據該院的資料指出，晚期肝癌的病人如果只侵犯血管分支或單純只有肝外轉移，合併雷莎瓦及血管栓塞或許能延長更多的存活時間。
總結來說，肝癌的診斷，目前大部分的病人在診斷時屬於無法根治的中期或晚期。篩檢上仍有很大進步的空間。有慢性肝炎的病人，尤其是B型及C型肝炎病人，應定期追蹤自己的肝臟，包括定期超音波及抽血檢驗，才能達到早期診斷，早期治療的目的。如果有意願治療慢性肝炎且能夠治療，最好接受治療。醫生應不斷的勸導慢性肝炎的病人接受治療及追蹤。一旦發現肝癌，成大醫院目前的治療技術也比以往進步，希望病人不要灰心氣餒，配合醫師，可共創最好的健康願景。