食藥署說，不符規定藥品主要涉及使用食品級或食品添加物許可證的碳酸鎂（鈣）做為主成分，都已要求廠商將相關產品於4月22日午夜前下架，30日內完成回收（其中3家藥廠已主動回收涉案產品），庫存品封存停止出貨；在賦形劑部分，廠商皆依藥典規格逐批抽樣檢驗合格後使用。
根據食藥署網站公告表示，第二波全面清查結果，自104年4月13日至4月17日止共查核48家，有19家業者共23項產品不符規定。其中包含市面上常見的新萬仁「金十字酵素胃腸藥顆粒」、五洲製藥「鐵胃胃腸藥顆粒」，田邊製藥的「田邊胃保錠」、「胃腸藥錠」等，都違反不能添加食品級碳酸鎂（鈣）的規定。
食藥署已立即要求業者將產品下架回收，並視違反情節，依違反藥事法第21條處新台幣6萬至30萬元罰鍰，或依違反藥事法第57條（嚴重違反GMP規定:限期改善、涉案產品停止生產，並處新台幣3萬至15萬元罰鍰）處置。