由於立法院臨時會預計處理「自由經濟示範區特別條例草案」，引發對條文內容有質疑的在野黨以及學者的憂慮。台大經濟系主任鄭秀玲、台大農經系主任吳榮杰、中興農經系主任曾偉君、中興大學農業政策中心特聘教授陳吉仲與屏科大農企業管理系主任陳淑恩等人今天(16日)舉行記者會，再度指出示範區條文對農業的相關衝擊。
陳吉仲表示，示範區中的農業加值只圖利少數人，卻對台灣農業有很大的衝擊。他指出，示範區一口氣開放830項農產品，甚至可以免除相關稅賦，這將犧牲國內農業。陳吉仲說：『(原音)原料加工完的產品有進到國內市場，那怎麼還會有說管制性農產品沒有進到國內市場？他在玩文字遊戲。比如說花生就沒有進到國內市場，前提是管理非常完美，可是它提煉完的加工製品就是進到國內市場，所以在這42條裡面就是會嚴重衝擊國內農產品。』
他並指出，在農業加值部分，特別條例准許未開放進口的大陸原物料在園區內加工，並可透過MIT(Made in Taiwan)方式對國內與海外市場行銷，如果MIT農業加值產品用的不是台灣原物料，就沒有任何意義。陳吉仲說：『(原音)用零關稅方式讓所有國外農產品包含中國大陸的農產品進來，如果你是食品加工業者，你會用誰的國家的食品原料加工？當你不是台灣的農產品原料加工的時候，那MIT還有意義嗎？那MIT掛的品牌是不是會摧毀原有的MIT呢？』
陳吉仲表示，如果政府對學者團體的質疑還有不清楚之處，他們願意就農業加值議題與政府辯論。