縣市合併後本局分凱旋、澄清及中正等3處辦公室，除了影響局內公文傳遞時效及人員管理不易之外，偶爾造成民眾申請案件跑錯地方之不便，但這些困擾即將全面改善。該棟建築物於102年7月31日取得使用執照後，立即進行內部裝修及辦公設備建置工作，以儘速完成集中辦公之目標，然搬遷工作仍以業務不中斷為原則，農曆過年前已完成澄清辦公室包括健康管理、長期照護、食品衛生及藥政科等單位進駐，另中正辦公室疾病管制處及檢驗科，則訂於3月15、16日2天搬遷進駐完畢，3月17日即全面於新大樓集中辦公，屆時以全新風貌為市民提供服務，並提高同仁的工作效率。