三年內須達廢水零排放
環評通過的附帶條件，包括悠活必須在三年內達到廢水零排放，零排放之前，生活污水的放流水標準，化學需氧量（COD）不能超過30mg/L（法定100）、生物需氧量（BOD）不得超過15mg/L（法定30），總氮應小於15mg/L，總磷應小於2mg/L。
擔任環評大會主席的屏縣環保局長林雅文表示，悠活案最受爭議的關鍵，就是排放水對海域的影響，環評委員提出上述要求，「是生活污水全國最高標準」。此次環評是針對悠活一到六區全區審查，悠活需在一個月內完成環境影響說明書的修正送環保局，未來就算恢復營運，只要不符標準就可開罰，甚至要求停業。
悠活承諾努力保護環境
悠活董事長曾忠信表示，雖然環評委員非常嚴格來要求悠活，還是感謝秉公處理，讓悠活能為環境保護努力，所承諾的會竭盡所能做到。
律師批零排放只是空話
台灣環境律師詹順貴說，悠活渡假村早蓋好營運十四年，都沒有進行環評，縣府和墾丁國家公園管理處怎可能自打嘴巴，有條件通過只不過是一種「形式」。
詹認為，環評會要悠活三年內做到「汙水零排放」只是空話，觀光旅館在海邊的用水量如此大，加上又有游泳池，廢水量不可能全數回收，「就算統統回收拿來澆灌，澆灌到溢流入海，那跟排放又有什麼差別呢？」
屏縣環保聯盟理事長洪輝祥等人則表示，萬里桐海域珊瑚從二○○三至二○○五年的四十六．五七％覆蓋率，降到二○一二年的十七．四九％，悠活應提出數據證明不是他們影響，屏縣府縱容違法營運，如今又有條件通過環評，環團將提行政訴訟。
針對追討不法利得，屏縣環保局長林雅文說明，悠活過去十四年營運，應環評而未環評，會依行政罰法及環評法加重處分，環評法最高罰款為一百五十萬元，但最後裁罰金額將不受此限。