綠色和平組織發表「失控的生魚片戰爭」報告，並提出適當減少漁撈規模、遠洋漁船能有良好運作觀察員等建議。
漁業署回應，自1989年起全面實施漁船限建，避免漁業過度發展；後續更實施收購漁船以適當減少漁撈規模。
另外，在2005年至2008年間大幅削減鮪延繩釣船數，總計減少大型大目鮪釣漁船215艘（政府及民間合計投入經費約逾新台幣60億元），及減少小型鮪釣漁船船數31艘，維持配額與船隊規模相稱。
漁業署表示，自2002年起已開始推動訓練及培育觀察員相關計畫，迄今編列預算經費達新台幣5億3900餘萬元，目前國家觀察員編制共有68人，配合國際最新管理及保育趨勢。
綠色和平報告指稱遠洋漁船為血汗漁業部分，漁業署表示，外籍船員從事漁撈工作，薪資待遇主要由雙方衡量付出勞力、成本負擔及當地國生活水平，現行薪資待遇，一般均較當地國工資為高，也不乏外籍船員完成履約後再續約案例，指稱國內遠洋漁業為血汗漁業，有偏頗。