行政院發言人鄭麗文轉述說，衛福部已懲處，江揆要求類似事件絕不允許再發生。不過，政院人士強調，這只是第一步而已，後續還要調查清楚有無外傳的「內神通外鬼」的狀況。
衛生福利部次長兼食品藥物管理署長許銘能則指出，潘志寬及許景鑫被懲處調離主管職務，並將交付食藥署考績會懲處。潘志寬表示，對懲處沒有意見，公務人員調整職務是正常的事。
消基會祕書長雷立芬直指，懲處結果並沒有給業者和消費者一個交代。產品下架如此重大的決定，居然決定權只在到區管中心，沒有上承到署長，代表層級不須很高就可以決定產品下架，食品安全的控管如此不受正常程序，不但帶給業者重大打擊，也失去對消費者的保障。
對於懲處結果，國民黨立委蔡錦隆痛批，衛福部早就應該公布不合格油品的名單，拖拖拉拉把民眾搞得人心惶惶，尤其烏龍公文又搞死油品廠商，不曉得是食藥署內神通外鬼，還是螺絲太鬆，「整件事一定要有更高的官員負責到底」。
民進黨立委林淑芬抨擊，衛福部在整個油品事件上離譜到極點，打從大統爆發黑心油，就應該積極查廠，查油又搞烏龍，主事官員不敢扛責任，拿最低階的公務員當代罪羔羊，部長「有權做決策、出事卻免責」。
許銘能表示，此事是由潘志寬口頭指示下屬發布公文，公文從承辦人、科長、簡任官，最後由副主任許景鑫代替潘志寬蓋章決行，並未依照正常程序提交上級主管機關；公文程序依照事由有不同規定，將交由考績會詳細判定。
至於外界質疑烏龍事件是「內神通外鬼」， 許銘能強調絕不可能 ，因發出去的公文不是密件。
衛生福利部長邱文達昨在記者會中表達歉意，面對媒體詢問許銘能是否應負責？邱文達說，食藥署長人選還在徵詢中，有結果會儘快說明。
衛福部表示，遭波及業者如聲請國賠願意負責。但雷立芬表示，廠商聲請國賠必須舉證證實有損害，既費時又費功，業者只能自認倒楣，聲請可能性不大，食品廠商若聲請國賠應是首例。她認為，如果這種情況能舉證成功，那麼類似情形的塑化劑團體訴訟，一審判賠時就不只120萬了。