判決指出，蔡同榮是在九十八年十月擔任立委期間，從國防部前部長蔡明憲處得知有「行政院大陸礁層調查小組」參訪大陸的行程，便跟《自由時報》記者說蘇起透過助理指示內政部海洋探測研究團隊，把台灣周邊海域水文資料交給對口中國國務院，交換水下情資，自由隔日以頭版報導，蔡還在立法院開記者會回應官方澄清，補充蘇起是透過助理毛惠民少將，下令與中國接觸。
高院審理後認為，蔡同榮應該知道指稱蘇起透過助理把我水文資料交給與我國立場敵對的中國大陸，質疑他的國家忠誠度，會損害蘇的名譽，卻沒經合理查證，就行使職權外行為，私下向記者透露和開記者會散布消息，不但不能被言論自由保障，也不能享有立委的言論免責權。
合議庭審酌蔡同榮重創蘇起名譽的程度，以及造成他精神痛苦的情狀，昨日判決蔡應該要賠償一百萬元，並在三報頭版上登報道歉，以回復蘇起的名譽。雙方均可上訴。
刑事部分高院已依誹謗罪判蔡同榮有期徒刑三月，可易科罰金，並宣告緩刑兩年確定。