衛生局長林奇宏昨天緊急召開記者會，澄清權利金由專家計算，不是市府所訂，而這棟中心主要產品是高階健檢，收費參考北市各大醫學中心及區級以上醫院，符合市場行情。林奇宏強調，北市蓋觀醫中心不是為了賺錢，而是要帶動當地的產業發展。
媒體報導，觀醫中心位於聯醫陽明院區北投門診部原址，面積約四百七十四坪，完工後由得標廠商中榮康集團及老爺酒店共同投資，原預計今年六月底完工，年底營運，但工程明顯延宕。
另外，得標廠商第一年權利金只需繳交營運總收入的○．五％，之後從一％遞增至二％，總計十五年的權利金總額約一．一七億元，平均每年權利金約七百八十萬元，相較退輔會的棲蘭、明池森林遊樂區客房一年四千多萬元的權利金，觀醫中心的權利金明顯偏低。
媒體質疑，在北市溫泉總量管制下，台北市長郝龍斌以市長專簽的方式，特權批准為觀醫中心每天提供一百六十噸的青磺泉、白磺泉。
衛生局解釋，權利金是由規劃公司根據物價上漲指數，營利事業所得稅、融資等項目，考量自償率、回收年限所計算得出，觀醫中心的權利金十五年約一．一七億元，租金十五年約三．二億元，至於權利金比森林遊樂區客房還低，衛生局強調，森林遊樂區的住宿沒有替代性，但北投有其他旅館、溫泉，選擇性較多。
衛生局表示，營運移轉招商公告前，已將溫泉管線納入新建工程給水系統的要項，同時根據台北市自來水事業處附設溫泉營業章程規定，申請取得該大樓溫泉水使用權。
衛生局表示，觀醫中心預計明年初完工，明年底或後年初營運，營運商將成立北投健康保健基金會，逐年提撥盈餘五％，參與北投健康城市計畫，提供北投區民健檢折扣。