水利處正工程司吳彥聰表示，台北市現有三處陸上閘門，分別位在百齡橋、士林橋，以及研究院路的南深陸閘門，其中百齡橋和士林橋因位置較高，幾乎沒關閉過，但南深陸閘門則可能因四分溪水位上漲關閉，六一二當天就曾在上午七點關閉。
不過，南深陸閘門位處南港地區的唯一南北向要道研究院路，關閉後等於將研究院路「一切兩段」，會連帶影響周邊內湖、新北市汐止區交通狀況。
有民眾指出，六一二當天上午出門，包括南港路、康寧路、三重路，道路全都動彈不得，南湖大橋、環東大道也都塞滿車輛，事後才發現竟是因為南深陸閘門關閉造成，直批「太離譜！」
吳彥聰說，陸閘門關閉會影響交通，評估會更慎重，惟水文情況無法預估，難以提早明確告知確切關閘門時間，現已建立通報機制，未來只要水位上升到七公尺，除派人到現場準備，也會立刻通知交通、警察等單位預警，準備透過廣播、電視跑馬燈告知民眾和進行現場疏導。
六一二當天受困的張小姐抱怨，研究院路是南港區重要道路，要封閉應該要事前告知，早點提醒民眾和公車改道，當天廣播都沒聽到，下大雨出門心情已經大受影響，堵車更堵得「莫名其妙」，沒想到趕不及上班打電話請假，才又接到「停班停課」的消息，根本就亂成一團。