衛生署計畫健保局高雄聯合門診中心將於今年9月底停止看診，明年元月關閉，引起高雄市公教退休人員協會反彈。行政院南部中心副執行長林清強表示，將向行政院及總統府建議保留門診中心，否則也應與健保局臺北聯合門診中心同步，於三年後再裁撤。
衛生署健保小組副召集人曲同光表示，行政院在前年核定通過健保局組織法變成行政單位時，即附帶決定臺北兩個門診中心及高雄一個門診中心在三至六年內，逐步結束。
曲同光表示，臺北門診因為服務量較大，所以規劃比較晚結束，對於南部醫療界出現希望延長高雄聯合門診中心的訴求，健保小組會再研議。
健保局高雄聯合門診中心前身「公保門診中心」，84年改由健保局接手至今。健保局強調，前往該中心就診民眾八成以上為公教退休人員。從99年至今，每個月就診人次為1萬3千至1萬5千之間，該中心採自負盈虧經營模式，每月虧損約230萬至250萬元。
健保聯合門診在最早期共有六個，分別是臺北兩個、高雄一個、台中一個、台南一個及花蓮一個，但台南、花蓮及台中健保聯合門診因不堪長期虧損，在健保局99年改制為行政單位之前，即已陸續關閉。
由於健保局自己是保險單位，轄下還設門診中心，長期以來都為外界詬病，認為健保局與民爭利，加上各地門診長期虧損，多次在立法院遭立委質疑要求關閉，行政院才順著健保局改制，臺北兩個健保門診中心預計於民國104年熄燈，走入歷史。
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