整個脊椎動物世界中烏龜的演化來源一直是最難解的問題，在古生物學與形態學的觀點裡烏龜與所有爬蟲類是來自同樣的祖先。然而分子證據指出烏龜與鱷魚、鳥的關係是比較接近的。波士頓大學的一組研究人員在檢視約超過1萬組烏龜與其近緣物種的基因組後確認烏龜與鱷魚、鳥的關係比起蜥蜴、蛇和鱷蜥還要親近。 　　研究人員Nick Crawford藉由電腦數據分析不同動物的基因組後將他們的發現發表英國皇家學會的期刊Biology Letters，並挑戰了過去解剖學與古生物學對於烏龜起源的概念。Crawford說：烏龜曾是脊椎動物演化假說中未知的一類群動物，在形態學上烏龜被認為與演化成現今蜥蜴、蛇與鱷蜥的祖先較為接近。這個研究使用爬蟲類主要的演化支系類群中超過1000個基因位點，而且更是首次使用大量分子證據解讀烏龜演化地位的研究。研究人員同時也分析這些物種的mRNA，在1145個保守基因中利用單一核酸位點基因進行高通量分析，其結果也支持烏龜與鳥、鱷魚來自同一個祖先。 　　原文來源：N. G. Crawford, B. C. Faircloth, J. E. McCormack, R. T. Brumfield, K. Winker, T. C. Glenn. More than 1000 ultraconserved elements provide evidence that turtles are the sister group of archosaurs. Biology Letters, 2012