財政部短短十六天完成證所稅版本，如同陳揆所言「要減少股市不確定因素」。證所稅雖闖過財政部這第一關，但兩周來仍躺在政院審查程序，利益團體結合黨政高層，壓力遽增是不爭的事實，政院未能快刀斬亂麻，政府自己淪為股市的「不確定因素」。
公平正義是馬政府的施政主軸，不論奢侈稅開徵、二代健保補充費率到復徵證所稅，都圍繞在此一架構下，陳內閣應熟悉這個施政方針。當財政部、金管會上演部會大戰，難道是互扮黑白臉的高明政治手法？
各方質疑復徵證所稅將導致股市量縮，進而衝擊證交稅，造成整體稅收下滑。這個憂慮本屬財政部提案階段，事先應有一套精算公式對股民釋疑。如今金管會與財政部相持不下，證所稅走不出行政部門，凸顯指揮系統出狀況。
財政部、金管會都屬國王人馬，彼此都有上達天聽的實力，陳揆未能即時化解僵局，有如本勞、外勞薪資脫鉤事件翻版，陳揆意見竟被勞委會推翻，意味整個執政團隊仍在磨合過程，讓團隊戰力大打折扣。
包括馬英九總統、陳揆多次把縮短貧富差距列主要施政重點，在符合公平正義的大原則下，復徵證所稅勢在必行。然而，政府決策過程拖沓，最後仍得靠總統拍板定案，行政團隊的磨合顯然出問題。