台灣豬隻施打的口蹄疫疫苗，雖有經費補助，然而注射率卻相當低，因此農委會計畫取消補助，引發養豬戶強烈不滿，立法院委員會也要求限期提出檢討報告。
防檢局副局長黃國青16日表示，補助疫苗是提升預防注射率的手段之一，但不是只靠疫苗，注射率就會提高。金門雖然疫苗完全免費，卻仍因為不施打而出現疫情，因此農委會目前正往多方向商討，提高注射率；包括加強現場監測、訂定裁處基礎標準、高風險豬隻由特約獸醫師強制施打、預防成效績優評鑑，及恢復肉品市場防疫清潔消毒競賽等。
黃國青說：『(原音)可能這些都是我們未來要採取的對策，還有對養豬戶我們會有查緝小組，到每個養豬戶去查，這是無預警的查緝，只靠縣市政府可能沒有辦法，這樣可能隨時會被我們查到。』
另外，日前屏東縣1家養豬場豬隻檢出口蹄疫非結構性蛋白抗體陽性，檢查後發現豬場健康情況良好，檢體也未驗出病毒，但仍對周邊3公里畜牧場進行調查，結果並沒有任何疫情傳出，因此列為個案處理。