紅十字會回應表示，援助大型國際賑災專案時，紅十字會每季定期上網公告進度與經費使用，並不定時發布新聞向大眾說明，另外，專案的財報表也依內政部社會司要求，定期提報，內政部每年也會指派會計師查核。
以日本賑災為例，紅十字會表示，所有款項撥付都依日本紅十字會的需求，經雙方商議後「分批撥付」，然而「分批撥付」並不表示「款項不清」。
紅十字會指出，在日本政府頒布復興法案時就確認六項援建計畫，並全程參與緊急救援與復原安置相關工作，與日方商定援建醫院、公營住宅、公民福祉館、老人住宅、保育園以及課輔中心六項硬體援建計畫。
致於海地援建案，紅十字會表示，這是與外交部合作，委請海外工程顧問公司在當地興建200戶台灣新希望村，據合約，所有款項皆依工程進度按期撥付，目前重建進度達50%，紅十字會總募款支出為50.6%，並無任何流向不清的問題。
至於南亞海嘯結餘款新增計畫，紅十字會表示，款項明確用於印度、孟加拉、斯里蘭卡、馬爾地夫以及緬甸五國，全都是南亞海嘯的受災國，經總會理事會通過並提報內政部備查在案。