環保署對違反環境教育法機關、學校全面清查，並將違反名單函送各直轄市、縣市政府，開出限期辦理通知書，如屆期仍不辦理，將處分該機關、學校新台幣5000元以上1萬5000元以下罰鍰，機關首長、校長或負責環境保護權責人員還要上1至8小時環境講習。
違反環境教育法第19條規定有3種情況，第1種未訂定101年環境教育計畫，第2種為未申報100年環境教育成果，第3種有申報成果但未達全體員工參與。環保署統計，共計有434個機關違反。各直轄市、縣市政府已針對上述3種違法情況，開立、寄發限期辦理通知書。
環保署說，結合地方政府環保、教育機關，舉辦近70場的網路系統申報說明會，辦理各機關學校環境教育指定人員的訓練班、研習營，另成立諮詢專線及環境教育輔導團，必要時請專家學者親自前往輔導，全台灣第1年申報率就超過9成，顯見大多數的政府機關、學校都能配合落實。
從所在地分析，100年度環境教育成果完成率最高的是澎湖縣達100%，其次為雲林縣99.71%，而最低是連江縣，僅8成完成申報。此外，101年度環境教育計畫申報，嘉義市、嘉義縣、雲林縣及澎湖縣，都已達100%，而連江縣不到8成，也是全國最低的申報率。
環保署呼籲，環境教育對永續發展有重大影響，各公部門應為民表率並確實遵守法律最基本要求，環境教育應該是快樂的學習，希望不要演變成被罰款後才勉強去做，這將失去環境教育法立法原意。