受鳳凰颱風影響，台灣局部地區出現豪大雨，造成農業災情。根據農委會統計各地方政府通報的農業損失，以台東縣農損達近新台幣160萬最多，其次為花蓮縣和屏東縣。受損作物以香蕉最多。至於雲林縣、嘉義縣、桃園縣等短期葉菜主產區，則沒有重大災情傳出。
從台北果菜批發市場23日的交易情況看來，到貨量達到1,475公噸，比平日1,300多公噸的需求量還多。台北農產運銷公司主祕路全利指出，22日休市，23日是恢復交易的第一天，市場需求量通常會比較大，從到貨量來看，鳳凰颱風對台灣造成的農業損失有限。他說：『(原音)因為我們產地的了解，這次鳳凰颱風來襲，對主要蔬菜產區雲林、嘉義、彰化和南投並沒有帶來太大的影響。今天整個到貨量1,475公噸，所以看來台灣影響有限。』
儘管到貨量較平日多，不過，從整體蔬菜價格來看，每公斤達到新台幣32.5元，比颱風來臨前的26元上漲2成。台北農產運銷公司預估，若後續供應正常，菜價大約1週內就可以回穩。