根據中華民國乳業協會提供的數據，國內乳廠收購酪農的生乳價格每公升約新台幣33元，乳廠處理乳品後負責運輸，以每公升約60元出貨給通路商上架銷售，通路商的零售價則是每公升約90到100元，生乳價與零售價的比值約為1比3。相較之下，國外乳廠收購生乳的價格每公升約新台幣20到22元，雖然乳廠出貨給通路的價格不清楚，但國外通路售出價格每公升約60到65元，生乳價與零售價的比值約為1比2或1比2.5。
乳業協會認為，台灣通路售出價格偏高，且通路商僅處理上架銷售，未支出運輸成本，加上國產鮮乳保鮮期短、約12天，在期限內賣出就可獲利，疑似有市場壟斷的問題。陳駿季表示，這屬於市場運作的部分，農業部會予以關心。
乳業協會和酪農也指出，進口到台灣可保鮮90天的長效乳，若依舊可標示成「鮮乳」銷售，成本又較低，將嚴重衝擊國產鮮乳的營運。對此，陳駿季允諾會更積極與衛福部溝通，在標示上做區隔，目前農業部提出的方案包含標示成「長效乳」或「長效鮮乳」，他樂觀其成會過關。
此外，陳駿季也表示，農業部還會輔導國產鮮乳產業開發製作起司等多元化加工產品銷售，藉此調控產銷；同時搭配前端輔導酪農從目前國產鮮乳年產47萬公噸，降為43萬公噸，以因應紐西蘭乳品輸台零關稅的衝擊。農業部也將推動國產鮮乳導入學校飲用的措施，以提高國產鮮乳的市場需求。
面對紐西蘭乳品輸台關稅即將歸零的挑戰，農業部將從生產端到銷售端提出配套措施，透過標示區隔、多元產品開發、產量調控以及拓展通路等方式，維護國產鮮乳產業的競爭力，讓國人能夠享用到優質、新鮮、安全的國產鮮乳。