蔡英文總統520卸任前，外界遍傳府院黨幕僚單位已研擬赦扁配套措施，陳水扁則回應「毫無所悉」。對於前總統陳水扁被判有罪確定的龍潭等4大弊案，由總統特赦「免除其刑的執行」，但將沒收扁家已被扣案的11億元不法所得，以降低社會衝擊，仍待蔡英文最終拍板。
法務部指出，特赦是總統專屬的憲法上職權，赦免法規定總統應通知行政院命令主管部研議。總統府發言人林聿禪7日表示，總統府現階段的立場仍是，希望確保陳水扁獲得妥善的健康照顧，並依照相關的法律規範辦理。
2008年，陳水扁卸任總統職務，同年11月12日遭台北地院以涉嫌國務機要費案、洗錢等重罪為由收押禁見，後因龍潭購地等案遭判刑20年。馬英九執政時期，陳水扁在獄中屢屢傳出健康有問題，社會要求准許保外就醫，2015年1月，馬英九總統准扁保外就醫。
2016年，蔡英文上任總統，黨內傳出赦扁呼聲，但蔡英文透過總統府發言人對外表明，「目前最重要的是確保陳水扁獲得最好的照顧，早日回復健康」，未對赦扁做出正面回應。
赦扁最爭議的在於如何處理11億餘元的不法所得，其中已有約3億元沒入國庫，另有8億餘元還在查扣中。為避免特赦後，不法所得發還給扁家，引發外界反彈，將依法沒收不法所得。
國民黨立院黨團書記長洪孟楷表示，特赦是總統職權，而不是以特赦方式，一筆帶過所有案件，否則永遠無法了解真相。立委羅智強質疑，陳水扁踐踏保外就醫制度，甚至造成高雄監獄暴動，如此對得起司法嗎？
趙少康在臉書指出，陳水扁保外就醫後又是站台又是主持，早就是司法尊嚴最大的汙點，如果想被特赦，認錯、道歉、還錢三項條件，缺一不可，再啟動後續程序。
趙少康說，不管蔡英文劇本怎麼寫，阿扁貪汙的錢必須全部歸還，被查出的11億元都可能只是冰山一角了，更何況如果阿扁被特赦，在海外只凍結沒被沒收的8億元就要全部發還扁家，被查扣的豪宅、鑽石珠寶也會一併解凍，「這些都是民脂民膏，要人民怎麼接受？」
前立委沈富雄說，「今天很綠的人，到今天都還不相信阿扁貪污，他們認為阿扁拿到的所有的錢，是海外的建國基金；但也有很多人彈性疲乏，特赦不特赦都無所謂，我不排除，雖然只有13天，但就會突然來個特赦」。
中華民國史上過去曾有8次特赦，1937年1月4日，國民政府主席林森特赦西安事變策動者張學良；1961年10月30日，總統蔣中正特赦過失犯罪的蔡興；1965年11月3日，總統蔣中正特赦彭明敏；1990年5月20日，總統李登輝特赦美麗島事件27人。
2000年12月10日，總統陳水扁特赦因宗教而拒服兵役等19人、工運曾茂興、蘇炳坤；2007年6月21日，陳水扁特赦白米炸彈客楊儒門；2021年5月20日，蔡英文特赦布農族原住民獵人王光祿；2022年4月22日，蔡英文特赦中華民國陸軍花東防衛指揮部前少將參謀長韓豫平與侍從士張淯森。未來阿扁是否會是史上第9次特赦，備受關注。