政府從今年開始執行專案進口雞蛋，卻陸續爆出採購資訊不透明、補貼價差等問題，並且由於採購條件、規格、通路和保存都未妥善規畫，導致5億元公帑補貼的進口蛋，竟有近2億元的蛋面臨過期銷毀。此外，進口蛋風波引發的多個案件，除了「Lin bay好油」林裕紘自導自演恐嚇案遭收押禁見之外，包括農業部、中央畜產會在內，均不見檢調有任何的搜查行動，也遭質疑「辦民不辦官」、相關事證恐怕早已遭湮滅。
由於國內雞蛋產銷不穩，畜牧界普遍認為進口蛋專案將持續執行到明年，但對於進口蛋的品質、安全及衛生等條件，應由專家訂定標準作業程序。據媒體報導，前畜產會退員表示，民間本就有進口雞蛋，若要由政府專案補貼進口價差，就應對業者有所要求。儘管爭議百出，但食藥署目前仍將進口蛋視為散裝蛋，不強制要求標示有效日期，且煮熟成茶葉蛋後，仍屬「實質轉型」，原產地可標示台灣，有專家就認為，這樣的做法實際上就是在灰色地帶。
而進口蛋引起的爭議案件，目前雖有6個地檢署分案調查，包括農業部前部長陳吉仲、中央畜產會前董事長林聰賢等十多人都列被告，但目前檢方仍以查辦蛋商為主，對於農業部是否涉嫌圖利超思公司，至今未見任何行動。
對比多個蛋商被檢方訊後即快速交保，爆出自導自演恐嚇案的「Lin bay好油」林裕紘及國民黨黨工許哲賓目前仍持續收押禁見中，有評論指出，進口蛋爭議爆發迄今已兩個多月，包括農業部、中央畜產會都被認為是最關鍵、也最該被究責的單位，目前都不見檢調有任何的搜查行動，更被質疑「辦民不辦官」。
據媒體報導，北檢關於混蛋案件共5案，分別是遭控圖利進口境外蛋的超思3800萬服務費、指示業者將進口蛋產地改標為台灣、浪費公帑2億元銷毀5402萬顆過期蛋等等，包括陳吉仲、林聰賢、農業部代理部長陳駿季、畜牧司長張經緯等多位官員，被告發圖利、詐欺、瀆職、教唆犯罪、偽造文書、商品虛偽標記及違反食安法等罪，但目前為止，對於這幾人檢調均無具體動作。