益生菌（probiotics）、益菌生（prebiotics）與發酵食品都有助於維持腸道的多樣性。「益生菌」適量補充對宿主有益健康的微生物，但必須有足夠的活菌抵達腸道才有功效。
絕多數的益生菌是屬乳酸菌，能分解醣類產生乳酸、醋酸、丙酸、丁酸、短鏈脂肪酸，可酸化腸道環境、抑制害菌增殖、調解菌叢平衡、改善腸蠕動消化、提升免疫、預防過敏，並增加維生素、酵素、干擾素合成。常見的有乳酸桿菌、雙歧桿菌、酵母菌等。
而「益菌生」則指透過食物補充，以增加腸內益生菌生長，屬「養菌」性質，包括寡糖、膳食纖維及一些中草藥。含有益生菌及益菌生兩種合成的製劑稱為「合生元」（symbiotic）。
利用乳酸劑培育後，將菌體物質及其分泌物萃取之產物稱為「益生素」（biogenics），而含益生菌、益菌生及益生素三種功效之物質稱為「益生源素」（prebiogenics）。
早期對於偽膜性大腸炎復發或炎症性腸病的治療，使用「糞菌移植」（fecal bacterial transplantation）治療，得到不錯療效。
接著有了「糞菌膠囊」之口服療法，仍寄望以健康人的菌群來改善病人之腸道菌群，進而改善疾病。最近「精神益生菌」（psychobiotics）的研發與應用，聯結了腸道與神經心理領域，期待將來能展現良好成果。
我們錯把細菌當作敵人，設法把它們趕盡殺絕，對於益菌與壞菌一視同仁的「殺無赦」。從最近「腸道菌叢」與「腸道菌相」的研究，讓我們瞭解應該要珍惜且敬重與我們互利共生的無害益菌，它們是人類的一部分，比我們想像的還富有「人性」。
細菌伙伴們以獨立之心，行合群之事，也是人性的細菌社會，甚至比我們更具有「神性」。共生菌的新知不斷的累積，更為全體人類帶來全新的視野和契機。
調整我們的飲食行為，「腸樂我淨」不但可讓每個人變得更健康，擺脫疾病的困擾，也可讓貧困世界的苦難人們獲得更公平、更健康的飲食，更可以讓地球環境與資源永續發展。
本文出自聯經出版《腸樂我淨．素無量心》一書