近年來，越來越多農地與養殖魚塭，出現太陽能板，不過也引發質疑衝擊農業生產，甚至破壞環境生態，農委會則表示，未來要變更農地設置太陽光電，2公頃以上，由原來地方審查改由中央，而2公頃以下，除非農地已經無法農用，否則一律不同意變更。
台南七股養文蛤的漁民，不滿政府要推漁電共生，來到市府抗議，他們擔心加裝太陽能板後，怕文蛤養不好，也怕地主可能會趁機提高租金，農委會表示不會貿然推動。
農委會主委 陳吉仲：「養殖魚塭的地主，跟漁民是同一個人(才能申請)，這樣就不會有問題。」
農地上不斷長出太陽能光電板，也引發不少質疑，甚至變更地目，導致農地流失以及破碎化，農委會強調會加嚴把關，2公頃以上，審查權由地方移到中央，2公頃以下，除非符合特定條件、難再耕作，否則一律不同意變更，沒有灰色地帶。
農委會企劃處長 蔡昇甫：「審查標準非常地明確，零星夾雜的可以做變更，其它一律不准。」
而更小的面積660平方公尺以下，全面禁止農地變更，對此環保團體予以肯定，表示亂象已存在2年多，應盡快亡羊補牢。
地球公民基金會主任 蔡卉荀：「他先做這樣子的一個關閉，我是認同的，而不是像現在，完全對變更都沒有，任何的阻止的情況下，其實光電它就會反客為主(取代農地)。」
為此農委會將修正，相關農地變更審查作業要點，近期會發布，不過2公頃以下，包含660平方公尺以下的開發案，已核准的不會溯及既往，而在審查中還有721件，農委會承諾會依循農地保護的精神來審查。