南投縣長林明溱8日表示，現行「一例一休」太複雜，業者和老百姓都搞不清楚，因此縣府將在尊重中央、不違背法令前提下，訂定南投縣自治條例，並將加班費訂為日薪的1.5倍；盼本次議會定期會審議通過後，送勞動部核備。將來如果有一點違反法律，但符合自治條例規範，縣府就不會開罰。
對此，勞動部次長郭國文9日回應指出，勞基法新制是全國一致的規範，法律效力及於全國，凡是適用勞基法的事業單位均應遵守勞基法規定；地方的自治條例也不得逾越，若違反勞基法的規定，當屬無效。他說：『(原音)針對南投縣長對外宣布說想要採取自治條例的方式，來改變加班費的計算方式，從原來的1.34或1.67，變成1.5倍，或是每月加班總時數從46小時提高為54小時的說法，基本上已經違背並抵觸母法內容，這種情況底下，基本上是無效的，除非透過立法院的修法，否則自治條例無法達到他預期的效果。』
郭國文也指出，新法實施以來，各界尚在調適期，勞動部與各縣市政府積極辦理修法説明會，協助企業在人力及工時安排上調適新規定。勞動部也正藉由「宣導、輔導、檢查」三個階段，希望雇主和勞工都可以適應法規，自4月起進行「臨場輔導」、「集體輔導」和「申請輔導」3措施，協助各產業調適週休二日新制。