縣府指出，嘉義區漁會本次理事會議程在總幹事聘任案前，理事提出散會動議，經表決通過，依會議規範第37條規定即宣布散會，未完成總幹事聘任。
依漁會總幹事遴選辦法第17條規定，應於該漁會屆次改選、理事會成立後60日內，完成理事會合法聘任決議，未能依限完成總幹事之聘任時，縣府重新辦理總幹事候聘人登記公告及進行遴選作業程序。
尋求連任的嘉義區漁會總幹事林俊雄，卻因漁業署認定不具候聘資格，被迫在理監事會改選後離職，他為討公道，委託律師打行政官司，並向漁業署所在地高雄地方法院聲請假處分。新任理監事會改選，因漁業署認定林俊雄不具候聘資格有爭議，新理事會將暫緩聘任總幹事，派漁會秘書朱碧霞代理。
嘉義區漁會第11屆新理監事會改選，理事長由監事戴澤文接任，常務監事洪蔡美珠連任，林俊雄贏選舉，還要為保住總幹事打法律戰延長賽，他已分別向行政院及法院，提訴願、聲請假處分。
林俊雄說，聲請假處分目的在保住總幹事身分，因漁會關係漁民權益甚鉅，不能沒有總幹事掌舵；漁業署說，林俊雄提示漁港安檢資歷只有查緝走私不符資格；林俊雄說，漁業署之前認定海巡署成立前的76年至89年執行漁船安檢等業務經歷，是漁業有關工作，具總幹事資格，他是在76年到80年海巡署成立前執行安檢等業務，依漁業署解釋當然與漁業工作相關。
他批漁業署在總幹事遴選登記，縣府打完分數後，停止適用先前他從事漁港安檢具漁業專業知識公文，造成他警察資歷無法計分，漁業署之前認定他有候聘資格，他當1年多總幹事漁業署卻在選舉過程更改遊戲規則，侵害權益未通知他答辯有程序瑕疵。