台北市殯葬處及公運處於3月18、19、25、26日及4月1、2、3、4日等8天，分別在「富德公墓」、「南港軍人公墓」及「陽明山第一公墓」等墓區，規畫5線免費掃墓公車供民眾搭乘。台北市警局為確保掃墓公車運行順暢，維護墓區周邊道路交通秩序與安全，每日5時30分至17時實施交通管制。
首都客運、台北客運、大都會客運延續往年於富德靈骨樓、富德公墓辦公室、陽明山靈骨樓等3大轉運點，附設乘客服務中心，提供廣播、諮詢、兒童照護、出借愛心雨具...等便民服務，同時在墓區道路沿線懸掛大紅布條，指引民眾搭乘掃墓公車。
首都客運指出，預期今(106)年清明節連續假期掃墓人潮將達80萬人次以上。根據往年經驗，清明節當日是掃墓人潮的高峰，建議避開尖峰時段，提早上山掃墓，並多利用大眾運輸工具，以避免道路壅塞及找不到停車位的困擾。
其中，木柵線、南港線、崇德線及陽明山線尖峰3至5分一班、離峰5至10分一班，更在運能最大的木柵線採摩天輪式派車，尖峰時刻不斷派車，於崇德線及陽明山線以捷運列車式派車，減少上下山車輛會車所須等待的時間，以提高路線的疏運能量。
首都客運表示，由於崇德線受道路條件限制，僅能採中型巴士營運，建議欲前往富德公墓、富德靈骨樓掃墓的民眾，搭乘捷運至動物園站2號出口轉乘掃墓公車木柵線，或至昆陽站搭乘270、藍25等公車至中華科技大學，轉搭掃墓公車南港線，崇德線公車則留給在崇德街沿線掃墓的民眾搭乘。
另外，前往陽明山靈骨塔，可搭乘捷運至石牌站轉乘535、536、508、小8或至北投站轉乘230、小25等至惇敘工商轉乘掃墓公車陽明山線。木柵線及南港線均配置低地板公車，提供無障礙的公車服務，讓老弱婦孺等行動不便者，也能與家人上山掃墓。
台北市免費掃墓公車路線及班次，如下表：