交通部高喊全台多卡通，但目前在高雄市持「一卡通」搭渡輪只要半價、公路客運票價上限60元、市區公車1日2段吃到飽、公車捷運轉乘優惠3元，但其他電子票證全被排除在外。不過，最快4或5月就能突破重圍，享有一卡通相同待遇。
對此，有台北市議員質疑台北市府和高雄市簽了不平等條約，才使得悠遊卡在高雄市沒有享受到優惠，但反觀一卡通在台北市，早就比照悠遊卡享受捷運8折、公車轉乘等優惠。
持一卡通在高雄市搭公車或渡輪，一般乘客搭渡輪要40元、一卡通只須20元，搭公車享有「市區公車1日2段吃到飽」、「公車捷運轉乘3元折扣優惠」、「公路客運每次最高自負額60元」等優惠。
高雄市交通局表示，悠遊卡在高雄市要比照一卡通享有同樣的優惠，悠遊卡公司必須完成驗票機軟硬體設定，乘客持悠遊卡才能享受相關乘車優惠。悠遊卡公司已派員南下，預估最快今(106)年4或5月就能完成設定，悠遊卡持卡人即可享有同樣的優待。
針對高雄市公車、渡輪優惠方案，高雄市府強調是外界有所誤解，一直以來針對多卡通提供無差別待遇，並於去(105)年發函邀請一卡通、悠遊卡、icash、HappyCash等4家票證公司研商，進行相關設備軟硬體整合。
交通局預估，依目前作業時程，悠遊卡及HappyCash有錢卡最快在4月就能完成設定，就能享有與一卡通同樣的乘車、乘船優惠。至於icash愛金卡則是要等到今年下半年才能完成設定。