全教總指出，過去導師費被視為老師津貼，導師若請假就會被扣錢，但「教師待遇條例」在立法院三讀通過後，教師費與主管職的加給都算是「職務加給」，只要老師沒有請私假超過7天，導師費就不能被扣錢，年終獎金也必須比照主管職加給被納入計算。
全教總批評，法律都三讀通過了，教育部卻沒有提出因應措施，反而還函釋學校，指導師請假要扣導師費，讓學校莫衷一是。全教總批評教育部藐視國會立法，不負責任，影響十幾萬老師們權利，他們要對教育部表達強烈失望與憤怒。全教總理事長張旭政說：『(原音)本來「教師待遇條例」通過你就應該改的，你沒有改，教育部還放任這種情況讓它繼續混亂下去，然後不負責任地完全不把導師費變成加給這件事情放在眼裡。我們看到教育部一個函釋，還是把導師費當作當作津貼在看，完全不理會「教師待遇條例」通過以後，它就是加給這個事實。』
全教總強調，依照國會通過的法律，老師擔任導師與兼任行政主管的權利義務是同一套標準，不應有差別待遇，呼籲立法院對於教育部的漠視應予以譴責，並要求教育部立刻補正。