台大教授郭明良研究團隊多篇論文遭學術論壇網站PubPeer質疑違反研究倫理，有4篇波及共同作者、台大校長楊泮池。部分台大校內師生發起連署，要求涉案者負起政治責任。
東吳大學前校長劉源俊表示，行政不是簡單的事，能當上中研院院士，是學術成就好，而不是擅長行政。讓擅長學術的人掌握經費分配，就很可能走向組織論文工廠、騙取研究經費的路。
教改論壇多位學者呼籲楊泮池辭去台大校長職務以示負責。劉源俊說，這並非沒有前例，2005年美國加州理工學院校長巴蒂摩（David Baltimore）就因為指導一位博士後研究員，被檢舉論文造假，巴蒂摩最後自行辭去校長職務。劉源俊說，楊泮池可能覺得還不到必須「辭職」的條件，或可改為宣布明年不續任。
政大教育系教授周祝瑛也認為，研究人員和行政官僚是兩回事，中研院院士不適合當大學校長。學術強調自由獨立，行政官僚則要執行政策、做人際關係的協調，兩者身份易混淆，這也是為什麼台灣的學術官僚常會出問題。