邱垂正指出，兩岸互動交往多年，彼此存在著許多相處的默契，人事案方面，一向相互尊重對方，不評論、不干涉對方人事安排，兩岸應繼續相互尊重。
他表示，520以來，中國大陸相關部門對我在陸發展，持有不同立場的台商、企業界人士、演藝人員，屢有打壓，或要求進行政治性的表態，這種情形時有所聞，影響我民眾在大陸經商投資權益，這已經不是新聞。這樣的情形對兩岸營造健康的交流環境，造成不利影響，中國大陸方面以政治因素干擾兩岸正常交流互動的做法並不妥適，也不符合雙方推動兩岸關係和平發展的政策立場。
邱垂正強調，台灣是自由民主的社會，中國大陸方面應尊重台灣人民不同的主張，一再負面擴大解讀我方內部政策作為，將拉大兩岸人民的心理距離，無法真正贏得台灣人民對中國大陸處理兩岸關係的信賴與信任，過去台商容易受到大陸相關部門的騷擾，或是強求在立場上表態，這已經不是新聞了，不樂見這種拙劣手段在今後再度發生。
邱垂正也表示，未來政府一定會採取必要措施，持續關注並爭取應有的權益，肯定國台辦表達不評論、不介入的立場，也認為陸方不會讓這種狀況再次發生。