馮明珠曾在故宮圖書文獻處工作長達20年，並自2012年起擔任故宮博物院院長，於今年5月20日離職。今年9月，馮明珠受聘擔任北京故宮研究院顧問，引發各界不滿，民進黨立委莊瑞雄更批馮明珠「好像是已經在實踐兩岸一家親」，不過隨後故宮也說，馮明珠離開故宮前，將故宮政務官的管制期核定為三個月，因此馮明珠的行為無須經過故宮同意。
沒想到，馮明珠在今日確定離開北京故宮，馮明珠表示，離開北京故宮是為平息自己造成的風波，她沒想過自己到北京故宮任職會引起如此大的騷動與關注，更說北京故宮研究院是單純的學術交流平台，她在文化界服務了38年，相當樂意和世界各個博物館分享她的工作經驗、貢獻所學，並不認為有何不妥。
而對於自己在任期內將管制期從三年縮成三個月，馮明珠表示，將管制期限縮為三個月的政府單位也不只故宮，加上博物館不涉國家機密，該公文程序還經故宮法制人員、主任秘書、政務副院長簽核，主事單位都有核定查照，一切都是依法行事。
馮明珠也強調，自己絕對遵守國家法律規定，更不會洩漏國家機密。至於給各方造成困擾，她深以為憾。